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大兴安岭地区高寒的气候条件，成为两栖、爬行动物向北分布的主要限制因素。小鲵科动物世界上有30余种，国内有13种，但仅有一种分布到大兴安岭地区。即极北小鲵。它是本科中最耐寒的一种，向北可达北极圈的北纬65°。
大兴安岭区无尾两栖类较多。有6种，蟾蜍有二种，主要区别是花背蟾蜍雄性有鸣囊，背面花斑显著，通常成体个体略小于中华蟾蜍，所产蟾酥同等入药。
同时林蛙亦有二种，主要区别是龙江林蛙无声囊，体背和后腹部密布圆形大疣；而中国林蛙的雄性有内声囊，体背和侧面疣粒大小不等，但二种林蛙输卵管均同等入药。质量价格无差。青蛙在我国是广泛分布的种类，但在大兴安岭数量不如林蛙。
爬行动物与两栖动物相比，虽然已能更适应陆地生活。但仍还是变温动物。活动的季节和范围都受限于自然环境。共三种晰蜴和四种蛇。